Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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CBX3Q13185 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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