Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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