Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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