Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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