Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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