Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms