Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms