Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms