Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms