Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms