Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms