Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms