Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms