Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TOP2BQ02880 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOP2BQ02880 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms