Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD83Q01151 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD83Q01151 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD83Q01151 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD83Q01151 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD83Q01151 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD83Q01151 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD83Q01151 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD83Q01151 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD83Q01151 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD83Q01151 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD83Q01151 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD83Q01151 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms