Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms