Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms