Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms