Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms