Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTG1P63261 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms