Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms