Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms