Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms