Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP107P57740 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms