Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD4P55036 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms