Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP2S1P53680 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP2S1P53680 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms