Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF135P52742 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF135P52742 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms