Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE6CP51160 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms