Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGS4P49798 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RGS4P49798 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RGS4P49798 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RGS4P49798 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGS4P49798 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms