Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms