Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGER3P43115 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms