Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms