Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6P35125 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6P35125 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6P35125 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6P35125 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP6P35125 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP6P35125 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP6P35125 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP6P35125 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms