Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H1P32780 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H1P32780 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms