Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GJB2P29033 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB2P29033 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB2P29033 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms