Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRMP28827 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms