Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCAP28676 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCAP28676 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCAP28676 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms