Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PLNP26678 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PLNP26678 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PLNP26678 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLNP26678 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms