Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S100A1P23297 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S100A1P23297 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms