Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD247P20963 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD247P20963 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD247P20963 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD247P20963 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms