Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASTP20810 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASTP20810 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASTP20810 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms