Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCL3P20749 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCL3P20749 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms