Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms