Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB3P16520 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB3P16520 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB3P16520 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms