Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB1P16220 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREB1P16220 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREB1P16220 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREB1P16220 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREB1P16220 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREB1P16220 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms