Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSPP15924 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSPP15924 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSPP15924 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSPP15924 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms