Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms