Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALM2P0DP24 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALM2P0DP24 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms