Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms