Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC166P0CW27 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms